Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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