Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ROPN1BQ9BZX4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms