Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA7

TSSK1B, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK1BQ9BXA7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSSK1BQ9BXA7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms