Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRIP1Q9BX63 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms