Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM4

GGACT, Gamma-glutamylaminecyclotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGACTQ9BVM4 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
GGACTQ9BVM4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms