Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CDRT15Q96T59 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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CDRT15Q96T59 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDRT15Q96T59 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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