Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPS6KC1Q96S38 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms