Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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SAMD8Q96LT4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SAMD8Q96LT4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SAMD8Q96LT4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SAMD8Q96LT4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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SAMD8Q96LT4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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SAMD8Q96LT4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SAMD8Q96LT4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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