Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms