Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCARF2Q96GP6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms