Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NXPE2Q96DL1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXPE2Q96DL1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms