Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDAC11Q96DB2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms