Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYTL4Q96C24 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYTL4Q96C24 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms