Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms