Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBXN4Q92575 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms