Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM41Q8WV44 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms