Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC155Q8N6L0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC155Q8N6L0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms