Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD35Q8N283 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms