Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CDKL3Q8IVW4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKL3Q8IVW4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms