Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APTXQ7Z2E3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APTXQ7Z2E3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms