Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LRIG3Q6UXM1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRIG3Q6UXM1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms