Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC174Q6PII3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms