Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Q6P435 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q6P435 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q6P435 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q6P435 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q6P435 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q6P435 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Q6P435 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Q6P435 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q6P435 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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