Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H3F3CQ6NXT2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms