Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms