Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDKL4Q5MAI5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms