Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCID2Q5JVF3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCID2Q5JVF3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms