Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms