Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBPF1Q3BBV0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms