Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ9

DEFB110, Beta-defensin 110, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB110Q30KQ9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFB110Q30KQ9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms