Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms