Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL15Q16663 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms