Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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SGCAQ16586 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SGCAQ16586 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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