Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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GABRA6Q16445 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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GABRA6Q16445 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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GABRA6Q16445 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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GABRA6Q16445 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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GABRA6Q16445 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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GABRA6Q16445 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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