Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC85BQ15834 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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