Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NCF4Q15080 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms