Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPRHQ149N8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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