Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IHHQ14623 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IHHQ14623 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IHHQ14623 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms