Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SCARF1Q14162 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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