Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FOXE3Q13461 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FOXE3Q13461 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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