| FOXE3 | Q13461 | AC241585.1-201 | ENST00000433527 | 519 nt | BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PRICKLE2-AS1-203 | ENST00000476308 | 623 nt | TSL 2 BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC002310.2-201 | ENST00000486926 | 950 nt | TSL 2 BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | INGX-202 | ENST00000489074 | 768 nt | BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | C3orf67-212 | ENST00000491845 | 832 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LINC01336-202 | ENST00000506086 | 479 nt | TSL 5 BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL162231.3-201 | ENST00000556278 | 902 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SPCS2P1-201 | ENST00000561636 | 679 nt | BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PRR29-209 | ENST00000582540 | 967 nt | TSL 2 BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC087645.2-202 | ENST00000586583 | 643 nt | TSL 4 BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PRKCSH-217 | ENST00000592741 | 2100 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC141424.1-203 | ENST00000599026 | 887 nt | TSL 5 BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL390955.2-201 | ENST00000603032 | 514 nt | BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SPDYE12P-201 | ENST00000618416 | 771 nt | BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RAB34-223 | ENST00000636154 | 730 nt | TSL 2 BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CLN3-246 | ENST00000636228 | 1224 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LRIT1-201 | ENST00000372105 | 2228 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLC39A1-201 | ENST00000310483 | 2427 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ANKRD2-203 | ENST00000370655 | 1451 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | APOPT1-201 | ENST00000409074 | 2523 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLC43A3-203 | ENST00000395124 | 2617 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GLG1-202 | ENST00000422840 | 4748 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CD68-201 | ENST00000250092 | 1878 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GRID2IP-201 | ENST00000435185 | 3215 nt | TSL 5 BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GRB7-204 | ENST00000394211 | 2093 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NBL1-211 | ENST00000618761 | 2051 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DLGAP1-220 | ENST00000581699 | 2258 nt | TSL 2 BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CLU-215 | ENST00000523500 | 2381 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PPM1J-202 | ENST00000464951 | 2474 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | JRK-203 | ENST00000571961 | 2687 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RNFT2-203 | ENST00000392549 | 2896 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PLPPR4-203 | ENST00000457765 | 4846 nt | TSL 2 BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CLCN2-202 | ENST00000344937 | 3187 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.63 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MGRN1-201 | ENST00000262370 | 3968 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FHL2-205 | ENST00000393353 | 1531 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | IQCF5-AS1-201 | ENST00000440723 | 2000 nt | TSL 2 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TPD52L2-205 | ENST00000352482 | 2339 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TPD52L2-210 | ENST00000615907 | 2310 nt | TSL 4 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF408-201 | ENST00000311764 | 2442 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CREB3L3-201 | ENST00000078445 | 2618 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RFWD2-204 | ENST00000367669 | 3033 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ANKRD33B-201 | ENST00000296657 | 9188 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MLLT10-203 | ENST00000377072 | 5126 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GIGYF1-201 | ENST00000275732 | 6530 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LSS-205 | ENST00000457828 | 4390 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NSMF-205 | ENST00000371474 | 3571 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NSMF-208 | ENST00000437259 | 3577 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NTRK3-203 | ENST00000357724 | 2980 nt | TSL 5 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ADAM15-204 | ENST00000359280 | 2874 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | EXOG-201 | ENST00000287675 | 2792 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SNAPC1-201 | ENST00000216294 | 2656 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MAP4K1-208 | ENST00000589130 | 2654 nt | TSL 5 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HIPK4-201 | ENST00000291823 | 2452 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SEPT8-204 | ENST00000378699 | 2289 nt | TSL 5 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TXNDC2-201 | ENST00000306084 | 1873 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | C17orf100-201 | ENST00000542475 | 1756 nt | APPRIS P1 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PDLIM1-201 | ENST00000329399 | 1452 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KCNMA1-251 | ENST00000639090 | 4319 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | BCL2L2-PABPN1-203 | ENST00000557008 | 1366 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GMNN-201 | ENST00000230056 | 1262 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | USE1-201 | ENST00000263897 | 843 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | C1orf43-203 | ENST00000368516 | 872 nt | TSL 2 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC092580.3-201 | ENST00000430932 | 139 nt | BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TMEM120A-203 | ENST00000439537 | 1161 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL589923.1-201 | ENST00000441473 | 316 nt | TSL 5 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SERBP1P3-201 | ENST00000459980 | 809 nt | BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC106897.1-201 | ENST00000512874 | 394 nt | TSL 2 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RNF24-204 | ENST00000545616 | 1128 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MAPKAPK5-203 | ENST00000547305 | 494 nt | TSL 2 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | BANF1P1-201 | ENST00000553684 | 263 nt | BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL079307.3-201 | ENST00000556114 | 283 nt | BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NDRG4-247 | ENST00000568640 | 1281 nt | TSL 2 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF667-AS1-202 | ENST00000586091 | 678 nt | TSL 2 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC026803.2-201 | ENST00000599784 | 819 nt | TSL 3 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL133215.2-201 | ENST00000609242 | 977 nt | BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL138828.2-201 | ENST00000615812 | 383 nt | BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AQP12B-206 | ENST00000621682 | 1080 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AJ011932.1-201 | ENST00000621707 | 465 nt | BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TRIM45-201 | ENST00000256649 | 3515 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TMEM19-201 | ENST00000266673 | 5656 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LMNA-201 | ENST00000347559 | 3137 nt | TSL 5 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MICAL1-201 | ENST00000358577 | 3142 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PCDH10-201 | ENST00000264360 | 8489 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RGPD6-202 | ENST00000330331 | 2848 nt | TSL 2 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RGPD8-202 | ENST00000330575 | 2848 nt | TSL 2 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SPAG1-202 | ENST00000388798 | 3852 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RAB40B-206 | ENST00000571995 | 3859 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC104640.1-201 | ENST00000562617 | 2109 nt | BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SERAC1-201 | ENST00000367101 | 1907 nt | TSL 5 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FGF11-201 | ENST00000293829 | 3063 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RCOR3-204 | ENST00000452621 | 1827 nt | TSL 2 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TRIM27-202 | ENST00000377199 | 2967 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KIAA1217-206 | ENST00000376462 | 6123 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RIC8B-213 | ENST00000638198 | 1611 nt | TSL 5 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MCHR2-201 | ENST00000281806 | 2368 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DTD2-202 | ENST00000356180 | 1400 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MKRN3-203 | ENST00000568252 | 1312 nt | TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CYP46A1-201 | ENST00000261835 | 2181 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LINC00937-207 | ENST00000544461 | 3033 nt | TSL 2 BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CBLN4-201 | ENST00000064571 | 3024 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 12.62 | □□□□□ -0.39 | | |