Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE3BQ13370 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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