Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 311.8 ms