Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ITGB3BPQ13352 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ITGB3BPQ13352 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ITGB3BPQ13352 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ITGB3BPQ13352 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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ITGB3BPQ13352 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB3BPQ13352 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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