Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRSF5Q13243 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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