Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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