Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMAN2Q12907 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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