Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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EFEMP1Q12805 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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EFEMP1Q12805 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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EFEMP1Q12805 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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EFEMP1Q12805 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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