Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLFN5Q08AF3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLFN5Q08AF3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms