Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTDSPL2Q05D32 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms