Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PSMC1P12-201ENST00000436509 1314 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CCT6P3-203ENST00000452026 1383 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC104794.2-201ENST00000567540 1572 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC009269.2-201ENST00000559892 474 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TNP2Q05952 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms